대광고등학교와 강의석씨 사이에 진행되고 있는 재판의 1심에서 대광고가 패소한 이후 대광고와 총회 등 관계기관들이 항소를 하기로 의견을 모은 것으로 알려졌다. 지난 12일 교육자원부 산하 기독교학교위원회는 회의를 갖고 이번 사건은 대광고만의 문제가 아니라 한국교회와 기독교사학들이 함께 풀어나가야 할 과제라는 공통인식을 갖고 대광고가 항소할 것을 주문했다. 이미 대광고도 내부적으로 항소에 대한 입장을 굳힌 것으로 알려지고 있다. 이미 대광고 김광조교장은 "학교의 교육에는 문제가 없었고 강의석씨를 퇴학조치한 것도 예배에 참여하지 않았기 때문이 아니라 정상적인 교육행위를 불복했기 때문이었던 만큼 항소를 통해 정의를 되찾겠다"고 밝힌 바 있어 대광고와 강씨 사이의 논쟁이 당분간 지속될 것으로 보인다.
　
하지만 항소를 한다고 해서 무조건 승소할 것이라는 낙관론을 기대하기 어렵다는 신중론이 벌써부터 제기되고 있어 귀추가 주목된다. 1심 패소가 2심에 악영향을 줄 것이라는 기본인식 외에도 교계의 대처방안에 혼선이 있다는 주장이 나오고 있다. 한 관계자는 "사실 사학법 재개정 등 교단과 전국교회들이 주력하고 있던 사안이 있었기 때문에 대광고 사태에 대한 관심이 상대적으로 소홀할 수밖에 없었던 면이 있기는 하지만 대광고측의 대응이 다소 소홀했던 것 아니냐는 의견이 없는 것도 아니다"라고 지적했다. 또한 내부적으로 1심 변호인이 2심에서는 교체될 것이라는 소문도 나오고 있는 실정이어서 2심에서 다소 혼란이 불가피할 것으로 보인다. 이에 대해 교육자원부 총무 김치성목사는 "대광고 출신들로 구성된 법률법인 등 대광고의 손이 미치는 인력풀이 잘 갖춰져 있는 만큼 2심에서는 모든 역량을 동원해 반드시 승소할 수 있도록 해야 한다"고 강조했다. 또한 강의석씨가 2심에서도 승소해 결과적으로 '기독교사학에서의 종교교육'에 대한 판례가 만들어질 경우 향후 학원선교의 문은 닫힐 수밖에 없다는 의견도 설득력을 얻고 있어 대광고가 2심에서 반드시 승소해야 한다는 당위성이 보다 고조되고 있다.
　
한편 기독교학교위원회는 지난 12일 회의에서 △기독교학교에서의 예배형식 다양화 △성경수업 외의 대체과목 선정 △평준화 정책에 대한 부당성 고발 등의 안건에 대한 연구를 진행하기로 결정해 기독교학교에서의 종교교육이 다소 변화할 것이라는 예상을 가능하게 하고 있다. 김치성목사는 "변화하는 시대에 걸맞는 종교교육을 하자는 수준에서 이야기를 나눈 것으로 외부압박에 대한 굴복이 절대 아니었다"면서， "보다 효과적으로 종교교육을 할 수 있는 방안을 모색해 나가는 계기가 될 것"이라고 기대했다.
　
고교 평준화의 문제점도 여전히 남은 과제다. 기독교사학 전반에서는 현재 고교 평준화가 이번 사태의 원인을 제공했다고 보는 입장이 강하다. 기독교학교위원회 회의에서도 평준화의 부당성을 알리는 캠페인을 시작해야 한다는 의견이 오고간 것으로 알려지고 있다.
경신중고 전 교목실장인 김종희목사는 글을 통해 "1969년 평준화가 시작된 이해 종단-교육부， 학교-교육부， 교사-학생 사이에 큰 갈등이 있어왔고 평준화 제도 자체의 모순이 종단학교들에게 큰 불이익을 줬다"면서， "강의석 사태로 대변되는 그간의 갈등이 기독교나 종교사학이 폄하되어야 할 일이 절대로 아니다"라고 단언했다. 김 목사는 "사학의 자율성과 특수성을 무시하고 교육평준화를 강행한 교육부가 이번 판견의 원흉이자 원죄임을 이번 재판부가 간과하고 교육부 봐주기의 정치적인 판결을 함으로써 불공정 오판의 불명예를 면할 수 없을 것이다"라며， 강한 어조로 평준화의 문제점을 언급했다.