한국기독교장로회 총회(총회장:박원근)는 지난 5일 일본 정부의 고이즈미 총리 앞으로 항의서한을 발송하고 일본 정부가 추진하고 있는 '출입국 관리 및 난민인정법' 개정에 대한 입장을 표명했다. 기장 총회는 이 서한에서 개정 '출입국 관리법'이 "재인외국인을 잠재적인 범죄자로 취급함으로써 인간으로서의 존엄성을 손상시킬 위험이 있다"고 우려하고 "재일대한기독교회 및 일본기독교회와 함께 귀추에 주목하면서 보다 적극적인 방식으로 우리의 입장을 관철시켜 나갈 것"이라고 밝혔다.

기장 총회 교회와사회위원장 김종맹목사는 이와 관련해 성명을 발표하고 '출입국 관리법' 개정의 중단을 요구하면서 "인종차별과 외국인 혐오 등 사회 불안을 조장하고 각종 갈등을 양산하게 될 것"이라고 경고하고 "외국인 등록법의 지문 날인 제도는 이미 많은 문제를 내포하고 있어 지난 2000년 4월 폐지된 바 있는데 테러방지를 목적으로 이를 다시 부활시키는 것은 일본국민과 재일외국인 사이의 불신과 위화감만을 조장하는 결과를 낳을 뿐"이라고 강조했다. 성명은 또 "차별을 명문화 하는 방식으로는 결코 사회 안정을 이룩할 수 없다"면서 "일본정부는 사회 안정과 평화를 위해서 화합과 공생의 길을 모색하여야 할 것"이라고 주문했다.