목회자가 상주하는 기도처에 대한 지원이 오는 2009년까지만 가능하다. 제92회 총회 셋째날 오후 교회자립위원회 보고에서 기도처에 대한 지원 방법과 1대 1 집중지원방식 등을 포함한 2008년 교회자립사업 지침이 본회의를 통과했다.

1대 1 집중지원방식을 골자로 하는 교회자립사업 지침에는 노회는 지원교회 1교회가 미자립교회 1교회를 책임지는 1대 1 집중지원방식을 원칙으로 지원하며 지원 금액이 적은 교회는 2,3개 교회를 묶어 한 교회를 집중지원하는 것으로 돼 있다.

또한 기도처에 대해서는 목회자가 상주하는 기도처는 해당 노회가 인정할 경우에 지원대상으로 인정하고 지원노회의 지원대상에서는 제외하며 2009년까지만 지원하는 것을 원칙으로 돼 있다.

이와 함께 교회자립사업 지침에는 광역시 지역 노회에 대해 2008년부터 자립노회로 전환하고 또 피지원 노회는 2009년부터 미자립교회에 대한 지원금에서 자노회 지원금 비율이 40% 이상이 되도록 했으며 지원 노회는 2009년부터 경상수입 대비 미자립교회 지원금이 최소 1% 이상 되도록 하고 있다.